Les GCO considèrent les associations de patients comme des partenaires indispensables et sont convaincus qu’elles jouent un rôle majeur auprès des patients et des professionnels de santé, dans l’information sur la maladie, l’optimisation de la prise en charge, l'accompagnement et le soutien. Les GCO entretiennent des interactions très étroites avec des associations de patients (liste ci-après non exhaustive) notamment pour la relecture des lettres d'information destinées aux patients qui participent à un essai clinique ou la vulgarisation des résultats des essais cliniques. Un partenariat peut s’établir afin de coordonner des démarches communes auprès de l’INCa ou la DGOS.