Les GCO entretiennent des interactions très étroites avec des associations de patients (jeunes, ados, anciens patients) et parents, voire avec des fondations. La liste ci-après n’est pas exhaustive. Les associations de patients,parents, proches ont intérêt à faciliter la réalisation d’études cliniques qui permettent de faire progresser les traitements et les prises en charge. Les associations de patients ou parents peuvent participer à des Conseil d’administration des GCO. Un partenariat peut s’établir afin de coordonner des démarches communes auprès de l’INCa, la DGOS…. (ex : préparation du Plan Cancer). La rédaction d’ouvrages en commun peut être réalisée comme par exemple un livret grand public d'information destiné aux parents et familles : "Mon enfant a un cancer".